ארגון הגג של העמותות בישראל שלח מכתב לראש הממשלה נתניהו בו טענו ראשי עמותות כי שר האוצר יאיר לפיד מסרב לחתום על נוהל חדש להסדרת פעילותם בשל העובדה שדבר כולל פעילויות בהן מעורבות עמותות וישיבות דתיות וחרדיות, ולדברי ראשי העמותות הדבר עשוי לפגוע בהמשך פעילותן הרחבה של עמותות הפונות לכלל האוכלוסייה.
בתגובת האוצר נאמר כי רוב הסיכומים אושרו למעט סעיף מסוים שיגובש נוהל מסודר בעניינו בעתיד הקרוב.
בתגובה טענו בארגון הגג של העמותות כי השר לפיד מנסה לפעול בשיטת הפרד ומשול בגלל חשבון שיש לו עם החרדים, כלשון התגובה.